去年と同じミスを…
(何故か普段は見えない)ホストなWindowsとの共有フォルダをマウントするために

vmware-config-tools.pl

したらXが起動しなくなった…。
ちなみに昨日の問題は、コマンドラインから直接

java -cp なんとか.jar クラス名 プロパティファイル.xml

だと正常に動作。上記のコマンドを run.sh に記述して

./run.sh

だと、javaアプリ中からプロパティファイルが見えないエラーとなる(絶対パスでも)。
ので、シェルだとユーザが自分じゃなくなる?のかも?試せば良いんだけどキーボードが英語モードになってしまってviが終了できない…。